L'USAID a entrepris une approche globale et multisectorielle dans la lutte contre l'épidémie du VIH/SIDA en Côte d'Ivoire, qui accroît l'accès aux services de prévention, de soins et de traitement. Pendant plus de 10 ans, le Bureau de la Santé de l'USAID a travaillé en étroite collaboration avec d'autres agences du gouvernement américain pour aider à sauver la vie des personnes séropositives et des malades du SIDA en Côte d'Ivoire à travers le Plan d'urgence du Président Américain pour la lutte contre le SIDA (PEPFAR). Les projets PEPFAR de l'USAID en Côte d'Ivoire comprennent l’assistance aux services communautaires liés au VIH, le renforcement de la chaîne d'approvisionnement pour assurer l'accès à un traitement qui sauve la vie, les programmes pour les orphelins et enfants vulnérables, les programmes combinés de prévention basée sur les preuves, ainsi que l'analyse d’information stratégique. L’USAID travaille en partenariat avec le gouvernement ivoirien, le secteur privé et les organisations non gouvernementales, pour offrir des services aux personnes vivant avec le VIH et le SIDA et entend contribuer à juguler l'épidémie grâce à des programmes et des partenariats ciblés.

Les besoins en services de planification familiale et de santé reproductive pour les femmes et les adolescentes sont élevés en Côte d'Ivoire. En plus du besoin non satisfait en matière de services de planification familiale, environ un tiers de toutes les adolescentes sont déjà mères ou actuellement enceintes. Le Gouvernement ivoirien s’est engagé à atteindre les objectifs ambitieux de planification familiale conformément au Partenariat de Ouagadougou et à l’initiative PF 20/20. L'USAID soutient le gouvernement pour la réalisation de cette vision ambitieuse à travers une stratégie nationale de planification familiale révisée et chiffrée. S’appuyant sur cet engagement, l'USAID a lancé en 2014 un programme de prestation de services de planification familiale dénommé Agir-PF, qui vise à accroître la demande et l'accès aux services de planification familiale de haute qualité. Ces investissements dans la planification familiale sont essentiels pour aider la Côte d'Ivoire à atteindre un développement durable, à réduire le taux de mortalité maternelle et améliorer la santé infantile.

A travers le Programme d’action du Président Americain  pour la Sécurité Sanitaire Mondiale, l'USAID collabore étroitement avec ses partenaires pour prévenir, détecter, contrôler et répondre aux menaces des maladies émergentes. Ces partenariats augmentent l’étendue des programmes en cours de l'USAID  en matière de renforcement des systèmes de santé pour une capacité nationale de réponse durable face aux menaces sanitaires émergentes. Dans le cadre d'une réponse gouvernementale d’ensemble, l'USAID a organisé des ateliers qui ont permis de mettre en relation les autorités sanitaires nationales et des experts en vue d'élaborer une stratégie nationale de préparation et de réponse à l'épidémie de la maladie à virus Ebola. L’USAID a entrepris des campagnes de santé et de changement de comportement et joue un rôle prépondérant dans la prévention de futures épidémies de maladies zoonotiques à travers le Programme de lutte contre les menaces pandémiques émergentes.